1x01 Ambush / Засада
Джедай мастер Йода и трое отважных солдат клонов должны лицом к лицу столкнуться с огромной армией дроидов, чтобы доказать силу и способность джедаев защитить планету и добиться мира для Республики…
Девиз серии: Великие лидеры вдохновляют других.

1x02 Rising Malevolence / Наступление «Злорадства»
Флот клонов терпит неудачи. Неожиданно десять кораблей погибают — никто не остается в живых. Ходят слухи о секретном оружии сепаратистов. Совет Джедаев посылает магистра Пло Куна для расследования. Он сталкивается с флагманом генерала Гривуса, оснащенным новым секретным оружием, выводящим из строя все электронные системы корабля. Гривус приказывает уничтожить всех выживших, чтобы сохранить секретность корабля, однако джедаю и группе клонов удается спастись в капсуле. На поиски отправляются Энакин Скайуокер и его падаван Асока Тано.
Девиз серии: Веру выбирают, а не навязывают.

1x03 Shadow of Malevolence / Тень «Злорадства»
Корабль «Злорадство» продолжает уничтожать республиканские корабли и направляется к медицинской станции Республики. Энакин Скайуокер разрабатывает план по атаке корабля и уничтожению Генерала Гривуса.
Девиз серии: Легок путь к мудрости для тех, кто не ослеплен собой.

1x04 Destroy Malevolence / Гибель «Злорадства»
Анакину Скайуокерy и его призрачной эскадрильи ценой огромных усилий удается серьезно повредить «Злорадство». На беззащитный крейсер нападает флот Оби-Вана Кеноби, однако благодаря хитрости Дарта Сидиуса генералу Гривусу удается захватить в плен сенатора Падме Амидалу
Девиз серии: Удачен тот план,что продуман до конца.

1x05 Rookies / Салаги
Группа дроидов-диверсантов атакует базу слежения близ Камино, охраняемую лишь взводом клонов. На базу также направляются коммандор Коди и капитан Рекс с инспекцией. Превосходящие силы дроидов захватывают базу и транслируют сообщение о том, что все нормально. Теперь главная задача клонов — дать Республике знать о готовящемся вторжении на Камино
Девиз серии: Уверенность приходит с опытом.

1x06 Downfall of a Droid / Утрата дройда
Флотилия из трех джедайских крейсеров располагается в пространстве внутреннего планетарного кольца, окружающего Ботавуи. Флот Гривуса движется к системе. Поскольку численный перевес на стороне неприятеля, Кеноби советует Энакину отступить. Однако тот наотрез отказывается — когда это Энакин отступал? Он приготовил сюрприз для Гривуса… Но в конце сражения Энакин теряет управление истребителем и теряет R2-D2. После боя Энакин и Асока отправляются на поиски…
Девиз серии: Доверься другу и тогда друг доверится тебе.

1x07 Duel of the Droids / Дуэль дроидов
Энакин, Асока, отряд клонов и взятый на замену R2-D2 дроид R3-S6 ищут секретный пост прослушивания сепаратистов. Они улавливают сигнал, посланный R2-D2, который и приводит их на пост прослушивания. Начинается спасательная и в то же время диверсионная операция…
Девиз серии: Держись друзей своих, чтобы сердце твое не стало холодным как разум.

1x08 Bombad Jedi / Джедая бомбад
Джа Джа Бинкс — джедай? Так и подумали дройды сепаратистов, когда увидели его в робе джедая. Падме, 3PO и Джа Джа Бинкс отправляются на далекую планету Родию, к старому другу Амидалы с миссией мира.
Девиз серии: Героев создает время.

1x09 Cloak of Darkness / Маска Тьмы
Асока и Мастер Джедай Луминара сопровождают Наместника Нута Ганрея на суд. Но они не знают, что Граф Дуку направил своего смертоносного ассасина Асажж Вентресс, чтобы та освободила неймодианца.
Девиз серии: Не бойся идти наперекор своим инстинктам.

1x10 Lair of Grievous / Логово Гривуса
Злобный лидер сепаратистов Нут Ганрей сбежал из-под стражи по дороге на Корусант, где ответил бы за военные преступления. С помощью зловещих агентов Графа Дуку, подлый наместник совершил дерзкое бегство. Получив известие о наглом побеге, Магистр джедай Кит Фисто проследил за угнанным кораблём до отдалённой системы, надеясь вновь вернуть Ганрея в руки правосудия.
Девиз серии: Могущество достигает лишь тот, кто контролирует свою силу.

1x11 Dooku Captured / Дуку в плену
После долгих и опасных поисков, джедаи, наконец, выследили лидера сепаратистов графа Дуку. Во время героической попытки схватить графа, пропал Энакин Скайуокер. Потеряв связь со Скайукером, Оби-Ван Кеноби направился туда, откуда Энакин связывался с ним в последний раз, на фрегат сепаратистов, одиноко дрейфующего на окраине дальных рубежей.
Девиз серии: Извилист путь к миру, но бесценен. Сколько бы препятствий к нему не было.

1x12 The Gungan General / Генерал Гунган
Дуку держат с целью выкупа. Сбежав от Рыцарей Джедаев — Энакина Скайуокера и Оби-Вана Кеноби, отвратительный Граф Дуку угодил в лапы пиратов, возглавляемых бандитом Хондо Онака. Стремясь заполучить Дуку, Республика согласилась выплатить Хондо огромную сумму в обмен на Лорда Ситхов. Но Энакин и Оби-Ван недооценили вероломное коварство Онаки и его банды. А Онака недооценил Джа Джа…
Девиз серии: Лучше проиграть с честью, чем преуспеть с помощью обмана.

1x13 Jedi Crash / Джедаи терпят крушение
Армия республики отступает. вызволяя джедая Айла Секура, терпящую поражение в неравном бою, Энакин Скайуокер был серьёзно ранен. Героям чудом удалось спастись, совершив аварийную посадку на окраинной планете. Потерпевшим бедствие и не имеющим средств связи с Республикой, джедаям оказывают медицинскую помощь лурмены — миролюбивые обитатели планеты. Асока и Айла должны найти свои ответы на вопросы: Асока — как она понимает философию Джедаев в плане личных привязанностей, а Аайла — являются ли Джедаи хранителями мира?
Девиз серии: Ничто так не питает зло как жадность и страх поражения.

1x14 Defenders of Peace / Хранители мира
Даже на мирной планете война настигает джедаев… Сепратисты решили испытать на планете, где потерпели крушение наши герои, новое сверхмощное оружие, воздействующее только на живую материю. Пока джедаи сражаются с новым оружием сепаратистов, мирные лурмены должны решить, придерживаться ли им своих принципов невмешательства в конфликт и умереть, или сражаться вместе с Рексом, Блаем, Энакином, Асокой и Айлой Секурой.
Девиз серии: Когда война пришла в твой дом, сохранять нейтралитет уже невозможно.

1x15 Trespass / Нарушители границы
Разгромлен аванпост Республики. Джедаи потеряли связь с силами безопасности клонов, расположенных на суровой заснеженной планете. В сопровождении высокопоставленных лиц с ближайшей луны Панторы, Оби-Ван и Энакин направлются в суровую местность расследовать исчезновение солдат-клонов. Они попадают в гущу нарастающего конфликта между пушистыми обитателями ледяной планеты и гордым и непримиримым председателем луны Панторы… Удастся ли добиться мира?
Девиз серии: Гордыня и мудрого к гибели приведет.

1x16 The Hidden Enemy / Скрытый враг
Планета в осаде. Войска сепаратистов безжалостно разрушают красивую и изысканную планету Кристофсис. Не в силах больше сдержать оборону народ Кристофсиса обратился за помощью к джедаям. В надежде спасти жизни и не допустить дальнейшее разрушение Оби-Ван Кеноби и Энакин Скайуокер придумали план, как переломить ситуацию в борьбе за эту ключевую систему. Однако, план раскрыт, а на джедаев устроена засада. Откуда сепаратисты знают каждый шаг клонов? Неужели среди своих есть предатель?
Девиз серии: Правда открывает глаза, но сердцу часто причиняет боль.

1x17 Blue Shadow Virus / Вирус «Синий призрак»
Боевые дроиды на Набу. Мятежные сепаратисты свирепствуют в Галактике, и угрожают даже мирным планетам. После обнаружения в полях Набу дроидов сепаратистов, планета вновь в повышенной боеготовности. Опасаясь нового вторжения на свою родину. Сенатор Амидала и делегат Бинкс спешат на Набу для оценки ситуации. Но вскоре окажется, что близ болот гунганов скрыта ещё более серьёзная угроза.
Девиз серии: Страх — это болезнь, единственное лекарство от него — надежда

1x18 Mystery of a Thousand Moons / Тайна тысячи лун
Джедаи и их доблестные клоны сорвали хитрый план сепаратистов по размещению бомб со смертельным вирусом «Синий Призрак» в важных системах Республики. Оби-Ван Кеноби и Энакин Скайуокер пленили подлого ученого доктора Нуво Винди не дав воплотить его гнусную затею.
Девиз серии: Случайность может спасти галактику.

1x19 Storm Over Ryloth / Сражение при Рилоте
Вторжение на планету Рилот! Из-за блокады флота сепаратистов и жестокой оккупации дроидов народ Рилота голодает. Злобный лидер сепаратистов Ват Тамбор правит железной рукой. В ответ на запрос сената Великая Армия Республики готовит наступление, чтобы освободить систему. Энакин Скайуокер и его падаван Асока готовят плацдарм для наземного вторжения Оби-вана.
Девиз серии: Тяжек путь к величию

1x20 Innocents of Ryloth / Невинные жертвы
Рилота Вторжение! Лидер сепаратистов Ват Тамбор взял под контроль планету Рилот и порабощает население. Смелой и неожиданной атакой джедай Энакин Скайуокер и его падаван Асока Тано сокрушили космическую блокаду ограждавшую планету. Генералы-джедаи Мэйс Винду и Оби-Ван Кеноби ведут крупномасштабное вторжение с целью освободить голодающие население.
Девиз серии: Невозможно исчислить цену войны

1x21 Liberty on Ryloth / Освобождение Рилота
Победа в руках Республики. Солдаты-клоны под командованием джедаев успешно вторглись в оккупированный сепаратистами мир — Рилот. Энакин Скайуокер сражается с врагами в небе, пока Оби-Ван Кеноби освобождает население из тисков подлого лидера сепаратистов Ват Тамбора. Генерал-джедай Мэйс Винду возглавляет атаку в финальной операции по освобождению столицы Лесу.
Девиз серии: Компромисс — добродетель которую нужно возделывать, а не слабость, которую нужно презирать

1x22 Hostage Crisis / Захват заложников
Возникла угроза! Несмотря на победы на Внешних рубежах, в самом сердце Республики зреет преступный заговор. Охотник за головами Кад Бэйн собрал самых опасных преступников Галактики и планирует дерзкий захват членов Сената. Но ради чего совершается этот подлый поступок?
Девиз серии: Общая тайна доверие формирует